بیوانفورماتیک
گروه پژوهشی بیوانفورماتیک به منظور پاسخگویی به نیازهای نرم افزاری محققین حوزه بیوتکنولوژی و ایمونولوژی با شرح وظایف زیر راه اندازی شده است:
- ایجاد و توسعه مدلهای بیولوژیک
- تحلیل رایانه ای داده های ژنوم های گیاهی و جانوری
- تحلیل رایانه ای و برنامه ای داده های پروتئوم های گیاهی و جانوری
- ایجاد ابزارها و زیرساختهای نرم افزاری در جهت اهداف پژوهشی مرکز
- تولید نرم افزارهای کاربردی جهت ارائه به سایر محققین
پروژه های فعال گروه :
- تخمین دقیق میزان انرژی آزد شده در داکینگ ملکول-پروتئین با استفاده از یادگیری ماشین جهت استخراج نقشه اثر ترکیبات شیمیایی موثر ضد سرطان
- شناسایی جایگاههای مستعد برهمکنش با دارو در ساختار پروتئین با استفاده از یادگیری عمیق
- استفاده از روشهای یادگیری ماشین بر مبنای گراف جهت تخمین دقیق خواص ترکیبات موثر در مهار رگزایی
- الگوریتم خوانش اعداد از تصویر صفحه نمایش وسایل خانگی برای نابینایان ( مجری طرح : خانم دکتر زهرا بهارلویی )
جهت همکاری و کسب اطلاعات بیشتر با خانم دکتر قاسمی تماس حاصل نمایید.
Selected Publications:
- A Vaez, PJ van der Most, BP Prins, et al. “lodGWAS: a software package for genome-wide association analysis of biomarkers with a limit of detection”, Bioinformatics 2016, 32 (10), 1552-1554.
- M Sehhati, A Mehridehnavi, H Rabbani, M Pourhossein, “Stable gene signature selection for prediction of breast cancer recurrence using joint mutual information”, IEEE/ACM Transaction on Computational Biology and Bioinformatics 2015; 12(6): 1440-1448.
- F Ghasemi, A Mehri, J Pena-Garcia, et al. "improving activity prediction of adenosine A2B receptor antagonists by nonlinear models", IWBBIO 2015, Part II, LNCS 2015, 635-644.
- E Saghapour, S Kermani, M Sehhati “A novel feature ranking method for prediction of cancer stages using proteomics data”, PLoS ONE 2017, 12(9): e0184203.
- E Saghapour, M Sehhati, “Prediction of metastasis in advanced colorectal carcinomas using CGH data”, Journal of Theoretical Biology 2017, 429:116-123.
- A Vaez, R Jansen, BP Prins, et al. “An in silico Post-GWAS Analysis of C-Reactive Protein Loci Suggests an Important Role for Interferons”, Circulation: Cardiovascular Genetics 2015.
- A Juluri, F Ghasemi, H Perez-Sanchez, R N Murthy, N Murthy, "IONTOPHORESIS-Captisol-Enabled (TM) Lipophilic drug complex delivered transdermally by Iontophoresis" journal of Drug Development and Delivery, 2015.
- M Sehhati, A Mehri Dehnavi, H Rabbani, S Haghjoo Javanmard, “Using protein interaction database and support vector machine to improve gene signatures for prediction of breast cancer recurrence”, Journal of Medical Signals and Sensors, 2013; 3(2): 87-93.
- A Mehridehnavi, M Sehhati, H Rabbani, “Hybrid method for prediction of metastasis in breast cancer patients using gene expression signals”, Journal of Medical Signals and Sensors, 2013; 3(2): 79-86.
- A Mehridehnavi, L Ziaei, “Minimal gene selection for classification and diagnosis prediction based on gene expression profile”, Advanced Biomedical Research, 2013; 2(2): 1-5.
